Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFAF6Q330K2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFAF6Q330K2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFAF6Q330K2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFAF6Q330K2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFAF6Q330K2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFAF6Q330K2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFAF6Q330K2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFAF6Q330K2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFAF6Q330K2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFAF6Q330K2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFAF6Q330K2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFAF6Q330K2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFAF6Q330K2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NDUFAF6Q330K2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDUFAF6Q330K2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms