Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UVSSAQ2YD98 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UVSSAQ2YD98 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
UVSSAQ2YD98 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UVSSAQ2YD98 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms