Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSMPQ1L6U9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSMPQ1L6U9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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