Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDR2Q16832 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDR2Q16832 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDR2Q16832 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDR2Q16832 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDR2Q16832 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDR2Q16832 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDR2Q16832 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDR2Q16832 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR2Q16832 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR2Q16832 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR2Q16832 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR2Q16832 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR2Q16832 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR2Q16832 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR2Q16832 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR2Q16832 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR2Q16832 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR2Q16832 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR2Q16832 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR2Q16832 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
DDR2Q16832 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms