Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBR1Q16650 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms