Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SMN1Q16637 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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