Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC37Q16543 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC37Q16543 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC37Q16543 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC37Q16543 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC37Q16543 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC37Q16543 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC37Q16543 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC37Q16543 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC37Q16543 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC37Q16543 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC37Q16543 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC37Q16543 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC37Q16543 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC37Q16543 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC37Q16543 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC37Q16543 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC37Q16543 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC37Q16543 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
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