Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPE65Q16518 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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