Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIK4Q16099 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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