Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB30Q15771 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB30Q15771 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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