Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALX1Q15699 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ALX1Q15699 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
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