Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM1Q15629 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAM1Q15629 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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