Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
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