Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC23AQ15436 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
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