Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms