Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLD3Q15054 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms