Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNIP1Q15025 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TNIP1Q15025 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TNIP1Q15025 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNIP1Q15025 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TNIP1Q15025 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNIP1Q15025 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNIP1Q15025 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNIP1Q15025 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNIP1Q15025 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNIP1Q15025 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNIP1Q15025 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TNIP1Q15025 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNIP1Q15025 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNIP1Q15025 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNIP1Q15025 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNIP1Q15025 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms