Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB39AQ14964 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB39AQ14964 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB39AQ14964 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB39AQ14964 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB39AQ14964 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB39AQ14964 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB39AQ14964 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB39AQ14964 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB39AQ14964 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB39AQ14964 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB39AQ14964 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB39AQ14964 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB39AQ14964 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB39AQ14964 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB39AQ14964 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB39AQ14964 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB39AQ14964 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB39AQ14964 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB39AQ14964 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB39AQ14964 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB39AQ14964 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB39AQ14964 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB39AQ14964 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB39AQ14964 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB39AQ14964 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB39AQ14964 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB39AQ14964 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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RAB39AQ14964 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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RAB39AQ14964 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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RAB39AQ14964 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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RAB39AQ14964 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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