Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF3Q14653 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF3Q14653 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IRF3Q14653 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
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