Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ERV3-1Q14264 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERV3-1Q14264 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERV3-1Q14264 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERV3-1Q14264 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERV3-1Q14264 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ERV3-1Q14264 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERV3-1Q14264 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERV3-1Q14264 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERV3-1Q14264 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERV3-1Q14264 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERV3-1Q14264 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ERV3-1Q14264 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERV3-1Q14264 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERV3-1Q14264 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERV3-1Q14264 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERV3-1Q14264 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERV3-1Q14264 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERV3-1Q14264 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERV3-1Q14264 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERV3-1Q14264 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms