Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPIDRQ14159 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIDRQ14159 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms