Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE1CQ14123 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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