Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBFBQ13951 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBFBQ13951 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBFBQ13951 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBFBQ13951 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBFBQ13951 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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