Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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