Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOFQ13790 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOFQ13790 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOFQ13790 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOFQ13790 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOFQ13790 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOFQ13790 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOFQ13790 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOFQ13790 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOFQ13790 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOFQ13790 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOFQ13790 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOFQ13790 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOFQ13790 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOFQ13790 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOFQ13790 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOFQ13790 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOFQ13790 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOFQ13790 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOFQ13790 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOFQ13790 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOFQ13790 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOFQ13790 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOFQ13790 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOFQ13790 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOFQ13790 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOFQ13790 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOFQ13790 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOFQ13790 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOFQ13790 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOFQ13790 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOFQ13790 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APOFQ13790 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APOFQ13790 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOFQ13790 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
APOFQ13790 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
APOFQ13790 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOFQ13790 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOFQ13790 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOFQ13790 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOFQ13790 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOFQ13790 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOFQ13790 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOFQ13790 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOFQ13790 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOFQ13790 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOFQ13790 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
APOFQ13790 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOFQ13790 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOFQ13790 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOFQ13790 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOFQ13790 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOFQ13790 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOFQ13790 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOFQ13790 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOFQ13790 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOFQ13790 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOFQ13790 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOFQ13790 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOFQ13790 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOFQ13790 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOFQ13790 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOFQ13790 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOFQ13790 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOFQ13790 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOFQ13790 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOFQ13790 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOFQ13790 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOFQ13790 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOFQ13790 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOFQ13790 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOFQ13790 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOFQ13790 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOFQ13790 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOFQ13790 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOFQ13790 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOFQ13790 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOFQ13790 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOFQ13790 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOFQ13790 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOFQ13790 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOFQ13790 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOFQ13790 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOFQ13790 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOFQ13790 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOFQ13790 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOFQ13790 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOFQ13790 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOFQ13790 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOFQ13790 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOFQ13790 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOFQ13790 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOFQ13790 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOFQ13790 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOFQ13790 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOFQ13790 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOFQ13790 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOFQ13790 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOFQ13790 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOFQ13790 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
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