Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPBGQ13641 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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