Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX1Q13596 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
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