Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD4Q13485 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
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