Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTA1Q13424 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNTA1Q13424 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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