Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSLNQ13421 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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