Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXF2Q12947 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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