Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TWF1Q12792 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TWF1Q12792 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWF1Q12792 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWF1Q12792 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWF1Q12792 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWF1Q12792 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWF1Q12792 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWF1Q12792 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWF1Q12792 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWF1Q12792 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWF1Q12792 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWF1Q12792 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWF1Q12792 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWF1Q12792 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWF1Q12792 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWF1Q12792 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWF1Q12792 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWF1Q12792 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWF1Q12792 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWF1Q12792 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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