Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAPQ12770 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPQ12770 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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