Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 ARN2YHL047C 1863 nt5.66□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 FRS1YLR060W 1788 nt5.66□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 CAX4YGR036C 720 nt5.66□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 IES1YFL013C 2079 nt5.66□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 PEX29YDR479C 1665 nt5.66□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 HXT4YHR092C 1731 nt5.65□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 GET3YDL100C 1065 nt5.65□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 YEL045CYEL045C 426 nt5.65□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 COS6YGR295C 1146 nt5.65□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 TOS3YGL179C 1683 nt5.65□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 ASK10YGR097W 3441 nt5.64□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 AIR2YDL175C 1035 nt5.64□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 MTF2YDL044C 1323 nt5.64□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 KAR2YJL034W 2049 nt5.64□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 FAU1YER183C 636 nt5.63□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 ARP1YHR129C 1155 nt5.63□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 HLJ1YMR161W 675 nt5.63□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 SDA1YGR245C 2304 nt5.63□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 NSI1YDR026C 1713 nt5.62□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 BGL2YGR282C 942 nt5.62□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 SNN1YNL086W 309 nt5.62□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 GSP2YOR185C 663 nt5.62□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 CLA4YNL298W 2529 nt5.62□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 SEG2YKL105C 3399 nt5.61□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 ARP2YDL029W 1176 nt5.61□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 RVB1YDR190C 1392 nt5.61□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 YIL067CYIL067C 2037 nt5.61□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt5.61□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 TRM10YOL093W 882 nt5.61□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 PXA1YPL147W 2613 nt5.61□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 SAM4YPL273W 978 nt5.61□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 MRL1YPR079W 1146 nt5.61□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 AFT1YGL071W 2073 nt5.6□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 GAT4YIR013C 366 nt5.6□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 OCA1YNL099C 717 nt5.6□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 RPO26YPR187W 468 nt5.6□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 YTA6YPL074W 2265 nt5.6□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 NUP1YOR098C 3231 nt5.6□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 ADE6YGR061C 4077 nt5.6□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 YDR134CYDR134C 411 nt5.59□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 MNN10YDR245W 1182 nt5.59□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.59□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 SYF2YGR129W 648 nt5.59□□□□□ -1.51
LSP1Q12230 MTC2YKL098W 1074 nt5.58□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt5.58□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 YNL174WYNL174W 573 nt5.58□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 CUE5YOR042W 1236 nt5.58□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.58□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt5.58□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 YMR155WYMR155W 1644 nt5.58□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 EUG1YDR518W 1554 nt5.58□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 SNF3YDL194W 2655 nt5.57□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 PRP43YGL120C 2304 nt5.57□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 SEC9YGR009C 1956 nt5.57□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 SIF2YBR103W 1608 nt5.57□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 HXT7YDR342C 1713 nt5.57□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 HXT6YDR343C 1713 nt5.57□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 ATG7YHR171W 1893 nt5.56□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 SUT1YGL162W 900 nt5.56□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 ZRT1YGL255W 1131 nt5.56□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 GPP1YIL053W 753 nt5.56□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 MSS116YDR194C 1995 nt5.56□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 BOP2YLR267W 1713 nt5.56□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 MET7YOR241W 1647 nt5.56□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 SUP35YDR172W 2058 nt5.55□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 RHB1YCR027C 630 nt5.55□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 CBT1YKL208W 816 nt5.55□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 KCH1YJR054W 1494 nt5.55□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 AKL1YBR059C 3327 nt5.54□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 RPN12YFR052W 825 nt5.54□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 PUS6YGR169C 1215 nt5.54□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 YGR182CYGR182C 354 nt5.54□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 SYN8YAL014C 768 nt5.54□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 SRN2YLR119W 642 nt5.54□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 SER1YOR184W 1188 nt5.54□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 YPR109WYPR109W 885 nt5.54□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 RSC30YHR056C 2652 nt5.54□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 HOS2YGL194C 1359 nt5.54□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 RRP3YHR065C 1506 nt5.53□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 SIR2YDL042C 1689 nt5.53□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 KNH1YDL049C 807 nt5.53□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 PCT1YGR202C 1275 nt5.53□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 YHR140WYHR140W 720 nt5.53□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 VPS72YDR485C 2388 nt5.53□□□□□ -1.52
LSP1Q12230 HRR25YPL204W 1485 nt5.52□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 TUL1YKL034W 2277 nt5.52□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.52□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 NCS6YGL211W 1080 nt5.52□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 YOR200WYOR200W 399 nt5.52□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 GRE1YPL223C 507 nt5.52□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 TOM5YPR133W-A 153 nt5.52□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 APM4YOL062C 1476 nt5.51□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 PAP1YKR002W 1707 nt5.51□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 YGR125WYGR125W 3111 nt5.51□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 ARO10YDR380W 1908 nt5.51□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 CDC10YCR002C 969 nt5.51□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 MHR1YDR296W 681 nt5.51□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 ERP5YHR110W 639 nt5.51□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 HMT1YBR034C 1047 nt5.51□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 CAR1YPL111W 1002 nt5.51□□□□□ -1.53
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