Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 VHS1YDR247W 1386 nt5.29□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 HOS2YGL194C 1359 nt5.29□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 JEM1YJL073W 1938 nt5.29□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 LCB2YDR062W 1686 nt5.28□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 DIT1YDR403W 1611 nt5.28□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 MRPL24YMR193W 777 nt5.28□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 ALG5YPL227C 1005 nt5.28□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 GIP1YBR045C 1920 nt5.28□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 NOT3YIL038C 2511 nt5.28□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 ADE4YMR300C 1533 nt5.28□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 WTM1YOR230W 1314 nt5.27□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 DAK1YML070W 1755 nt5.27□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 YIL092WYIL092W 1902 nt5.27□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 YDL121CYDL121C 450 nt5.27□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 SKI6YGR195W 741 nt5.27□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 NIT2YJL126W 924 nt5.27□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 SPG4YMR107W 348 nt5.27□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 OSW5YMR148W 447 nt5.27□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 PHA2YNL316C 1005 nt5.27□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 MCX1YBR227C 1563 nt5.27□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 YTA12YMR089C 2478 nt5.26□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 PMT2YAL023C 2280 nt5.26□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 PRT1YOR361C 2292 nt5.26□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 PRR1YKL116C 1557 nt5.26□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 YMR147WYMR147W 672 nt5.26□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 YNL019CYNL019C 855 nt5.26□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 YNL033WYNL033W 855 nt5.26□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 CTS1YLR286C 1689 nt5.26□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 AFT1YGL071W 2073 nt5.26□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 ACS2YLR153C 2052 nt5.26□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 THP1YOL072W 1368 nt5.26□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 ARH1YDR376W 1482 nt5.26□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 GPI18YBR004C 1302 nt5.25□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 NTH2YBR001C 2343 nt5.25□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 MEC3YLR288C 1425 nt5.25□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 FAU1YER183C 636 nt5.25□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 DBP8YHR169W 1296 nt5.25□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 YJL107CYJL107C 1164 nt5.25□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 PML1YLR016C 615 nt5.25□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 RPC19YNL113W 429 nt5.25□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 TOM5YPR133W-A 153 nt5.25□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 ATR1YML116W 1629 nt5.25□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 YNL095CYNL095C 1929 nt5.25□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 CYK3YDL117W 2658 nt5.24□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 PWP1YLR196W 1731 nt5.24□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 RSM10YDR041W 612 nt5.24□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 MRF1YGL143C 1242 nt5.24□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt5.24□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 MAC1YMR021C 1254 nt5.24□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 RPL3YOR063W 1164 nt5.24□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 ISU2YOR226C 471 nt5.24□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 TUB2YFL037W 1374 nt5.24□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 YIL067CYIL067C 2037 nt5.24□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 ATG1YGL180W 2694 nt5.23□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 GRS1YBR121C 2004 nt5.23□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 RRP45YDR280W 918 nt5.23□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 XPT1YJR133W 630 nt5.23□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 SCW10YMR305C 1170 nt5.23□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 YOL035CYOL035C 303 nt5.23□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 ECM33YBR078W 1290 nt5.23□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 LPL1YOR059C 1353 nt5.23□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 YDR132CYDR132C 1488 nt5.22□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 SPC42YKL042W 1092 nt5.22□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 SNF3YDL194W 2655 nt5.22□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 GCR2YNL199C 1605 nt5.22□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 ZUO1YGR285C 1302 nt5.22□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 SSY5YJL156C 2100 nt5.21□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 YBR138CYBR138C 1575 nt5.21□□□□□ -1.57
VPS54Q12071 YPL245WYPL245W 1365 nt5.21□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 MRE11YMR224C 2079 nt5.21□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.21□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 GTO1YGR154C 1071 nt5.21□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 SPL2YHR136C 447 nt5.21□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 RPB4YJL140W 666 nt5.21□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 TOM40YMR203W 1164 nt5.21□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 YPR150WYPR150W 522 nt5.21□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 LAP2YNL045W 2016 nt5.21□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 FUI1YBL042C 1920 nt5.21□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 YJR124CYJR124C 1347 nt5.21□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 PDI1YCL043C 1569 nt5.21□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 WHI4YDL224C 1950 nt5.2□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 VID30YGL227W 2877 nt5.2□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 NGR1YBR212W 2019 nt5.2□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 YCR006CYCR006C 474 nt5.2□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 IWR1YDL115C 1062 nt5.2□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 MRPL25YGR076C 474 nt5.2□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 PUS6YGR169C 1215 nt5.2□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 NSG1YHR133C 876 nt5.2□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 FUN19YAL034C 1242 nt5.2□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 AST1YBL069W 1290 nt5.2□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 PPG1YNR032W 1107 nt5.2□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 CLA4YNL298W 2529 nt5.2□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 ATE1YGL017W 1512 nt5.19□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 PCL6YER059W 1263 nt5.19□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 BUB3YOR026W 1026 nt5.19□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 CKB2YOR039W 777 nt5.19□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 STE12YHR084W 2067 nt5.19□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 FAA4YMR246W 2085 nt5.19□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 WTM2YOR229W 1404 nt5.18□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 FMP48YGR052W 1110 nt5.18□□□□□ -1.58
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