Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27E3Q08E93 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27E3Q08E93 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27E3Q08E93 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27E3Q08E93 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27E3Q08E93 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27E3Q08E93 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27E3Q08E93 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM27E3Q08E93 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms