Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 CDS1YBR029C 1374 nt5.48□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.48□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt5.48□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 SFT2YBL102W 648 nt5.48□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 DOA1YKL213C 2148 nt5.48□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 AIM10YER087W 1731 nt5.48□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 RPT2YDL007W 1314 nt5.48□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 YJR124CYJR124C 1347 nt5.48□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 ATG7YHR171W 1893 nt5.47□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 HRR25YPL204W 1485 nt5.47□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 PHM8YER037W 966 nt5.47□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 TRM10YOL093W 882 nt5.47□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 NDJ1YOL104C 1059 nt5.47□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 BIT2YBR270C 1638 nt5.47□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 RAD53YPL153C 2466 nt5.47□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 ASF2YDL197C 1578 nt5.46□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 TRS23YDR246W 660 nt5.46□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 ZPS1YOL154W 750 nt5.46□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 MNN2YBR015C 1794 nt5.46□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 HES1YOR237W 1305 nt5.46□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 VTC2YFL004W 2487 nt5.46□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 HXT5YHR096C 1779 nt5.45□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 LAS21YJL062W 2493 nt5.45□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 CWC21YDR482C 408 nt5.45□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 APS1YLR170C 471 nt5.45□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 NRM1YNR009W 750 nt5.45□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 ARG8YOL140W 1272 nt5.45□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 MET31YPL038W 534 nt5.45□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 YPL199CYPL199C 723 nt5.45□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 UBA3YPR066W 900 nt5.45□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 FAP1YNL023C 2898 nt5.45□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 SLT2YHR030C 1455 nt5.45□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 YHR140WYHR140W 720 nt5.44□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 CTR2YHR175W 570 nt5.44□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 PWP1YLR196W 1731 nt5.44□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 YLR296WYLR296W 327 nt5.44□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 YMR245WYMR245W 621 nt5.44□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 YNL174WYNL174W 573 nt5.44□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 YNL234WYNL234W 1281 nt5.44□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 snR32snR32 188 nt5.44□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 AVO1YOL078W 3531 nt5.44□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 NRD1YNL251C 1728 nt5.43□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 CDC10YCR002C 969 nt5.43□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 MRPL39YML009C 213 nt5.43□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 TLG2YOL018C 1194 nt5.43□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 YOL079WYOL079W 399 nt5.43□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 YPL191CYPL191C 1083 nt5.43□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 SRV2YNL138W 1581 nt5.42□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 YDL027CYDL027C 1263 nt5.42□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 SLC1YDL052C 912 nt5.42□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 RAI1YGL246C 1164 nt5.42□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 TRX2YGR209C 315 nt5.42□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 GAT3YLR013W 426 nt5.42□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 ACS2YLR153C 2052 nt5.42□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 ATM1YMR301C 2073 nt5.42□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 ROT2YBR229C 2865 nt5.42□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 AIR2YDL175C 1035 nt5.41□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 TRP1YDR007W 675 nt5.41□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 CAB1YDR531W 1104 nt5.41□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 PHO86YJL117W 936 nt5.41□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 RSA3YLR221C 663 nt5.41□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 NHP6AYPR052C 282 nt5.41□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 ASA1YPR085C 1332 nt5.41□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 MAL11YGR289C 1851 nt5.41□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 ELP3YPL086C 1674 nt5.4□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 YKR073CYKR073C 321 nt5.4□□□□□ -1.54
DSE3Q08729 BUD7YOR299W 2241 nt5.4□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 YMR102CYMR102C 2505 nt5.4□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 NGL2YMR285C 1548 nt5.39□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 YBR138CYBR138C 1575 nt5.39□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 SPT3YDR392W 1014 nt5.39□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 MPC1YGL080W 393 nt5.39□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 DBP8YHR169W 1296 nt5.39□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt5.39□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 YJL220WYJL220W 453 nt5.39□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 YIF1YNL263C 945 nt5.39□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 RSC6YCR052W 1452 nt5.39□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 PRM1YNL279W 1986 nt5.38□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 DBP9YLR276C 1785 nt5.38□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 SCS2YER120W 735 nt5.38□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 Q0144Q0144 330 nt5.38□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 SVF1YDR346C 1446 nt5.38□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 NTH2YBR001C 2343 nt5.37□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 YDR417CYDR417C 372 nt5.37□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 PDE1YGL248W 1110 nt5.37□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 snR10snR10 245 nt5.37□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 YEF1YEL041W 1488 nt5.37□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 PDR10YOR328W 4695 nt5.37□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 BUD22YMR014W 1560 nt5.37□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 PAD1YDR538W 729 nt5.36□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 MRF1YGL143C 1242 nt5.36□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 YLF2YHL014C 1218 nt5.36□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt5.36□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 PEX12YMR026C 1200 nt5.36□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 YMR114CYMR114C 1107 nt5.36□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 DOM34YNL001W 1161 nt5.36□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt5.36□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt5.36□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 ENP1YBR247C 1452 nt5.36□□□□□ -1.55
DSE3Q08729 RRP3YHR065C 1506 nt5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.1 ms