Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DHX9Q08211 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms