Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC3A1Q07837 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC3A1Q07837 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms