Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms