Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABPB1Q06547 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms