Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GABPAQ06546 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GABPAQ06546 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABPAQ06546 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms