Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN11Q06124 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN11Q06124 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN11Q06124 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms