Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCZQ05513 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCZQ05513 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms