Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTK2Q05397 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms