Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms