Protein–RNA interactions for Protein: Q04437

YKU80, ATP-dependent DNA helicase II subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKU80Q04437 SPO74YGL170C 1242 nt5.4□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 DBR1YKL149C 1218 nt5.4□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 ROT1YMR200W 771 nt5.4□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 CSG2YBR036C 1233 nt5.4□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 HXT7YDR342C 1713 nt5.4□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 HXT6YDR343C 1713 nt5.4□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 MCH4YOL119C 1506 nt5.39□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 LUC7YDL087C 786 nt5.39□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 YDL114WYDL114W 927 nt5.39□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 SFK1YKL051W 1062 nt5.39□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 SPC34YKR037C 888 nt5.39□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 YGP1YNL160W 1065 nt5.39□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 TFG1YGR186W 2208 nt5.39□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 MAL13YGR288W 1422 nt5.39□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 ADE13YLR359W 1449 nt5.39□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 WTM2YOR229W 1404 nt5.39□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 PSE1YMR308C 3270 nt5.38□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 APL6YGR261C 2430 nt5.38□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 AIM41YOR215C 558 nt5.38□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 ENV7YPL236C 1095 nt5.38□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 CTR1YPR124W 1221 nt5.38□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 ADE6YGR061C 4077 nt5.38□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 UGA1YGR019W 1416 nt5.38□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 FKH1YIL131C 1455 nt5.38□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 CDC4YFL009W 2340 nt5.37□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 MNS1YJR131W 1650 nt5.37□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 NOC4YPR144C 1659 nt5.37□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 SAP155YFR040W 3009 nt5.37□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 SOG2YOR353C 2376 nt5.37□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 BRF1YGR246C 1791 nt5.37□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 RRP4YHR069C 1080 nt5.37□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 YHR214WYHR214W 612 nt5.37□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 YAR066WYAR066W 612 nt5.37□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 YLR402WYLR402W 192 nt5.37□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 SOL1YNR034W 966 nt5.37□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 RPL3YOR063W 1164 nt5.37□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 DCI1YOR180C 816 nt5.37□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 RPS9AYPL081W 594 nt5.37□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 MTF2YDL044C 1323 nt5.37□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 YTA6YPL074W 2265 nt5.37□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 HAP1YLR256W 4509 nt5.37□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 MMP1YLL061W 1752 nt5.37□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 YDL109CYDL109C 1944 nt5.36□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 UBA2YDR390C 1911 nt5.36□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 GRE3YHR104W 984 nt5.36□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 YJL215CYJL215C 360 nt5.36□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 AAD15YOL165C 432 nt5.36□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 SAS4YDR181C 1446 nt5.36□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 SET4YJL105W 1683 nt5.36□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 IMA1YGR287C 1770 nt5.36□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 ACF2YLR144C 2340 nt5.36□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 SED4YCR067C 3198 nt5.36□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 SIT4YDL047W 936 nt5.35□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 STE50YCL032W 1041 nt5.35□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 BUL1YMR275C 2931 nt5.34□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 STE7YDL159W 1548 nt5.34□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 RAD57YDR004W 1383 nt5.34□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.34□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 YGL118CYGL118C 438 nt5.34□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 SUA5YGL169W 1281 nt5.34□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 YGL185CYGL185C 1140 nt5.34□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 ECM19YLR390W 339 nt5.34□□□□□ -1.55
YKU80Q04437 MTQ2YDR140W 666 nt5.33□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 PRS2YER099C 957 nt5.33□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 VTA1YLR181C 993 nt5.33□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 YET2YMR040W 483 nt5.33□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 ISA2YPR067W 558 nt5.33□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 ATG12YBR217W 561 nt5.33□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 SRB6YBR253W 366 nt5.33□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 SEC39YLR440C 2130 nt5.33□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 STE20YHL007C 2820 nt5.33□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 MBP1YDL056W 2502 nt5.32□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 YGL262WYGL262W 528 nt5.32□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 YBR139WYBR139W 1527 nt5.32□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 TEF1YPR080W 1377 nt5.31□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 TEF2YBR118W 1377 nt5.31□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 DEG1YFL001W 1329 nt5.31□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 DFM1YDR411C 1026 nt5.31□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 PFA5YDR459C 1125 nt5.31□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 BUR6YER159C 429 nt5.31□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 YFR035CYFR035C 345 nt5.31□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 RPS0BYLR048W 759 nt5.31□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 YLR126CYLR126C 756 nt5.31□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 YNR068CYNR068C 819 nt5.31□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 KRS1YDR037W 1776 nt5.31□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 CAF4YKR036C 1932 nt5.31□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 SEO1YAL067C 1782 nt5.3□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 MRK1YDL079C 1506 nt5.3□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 snR57snR57 88 nt5.3□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 PCL9YDL179W 915 nt5.3□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 YGR066CYGR066C 879 nt5.3□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 YLR346CYLR346C 306 nt5.3□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 NRG2YBR066C 663 nt5.3□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 LDB17YDL146W 1476 nt5.3□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 TDA7YNL176C 1911 nt5.3□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 CTS1YLR286C 1689 nt5.3□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 HPC2YBR215W 1878 nt5.3□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 PMT5YDL093W 2232 nt5.29□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 SNT2YGL131C 4212 nt5.29□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 CUE2YKL090W 1332 nt5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.7 ms