Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	ARN1	YHL040C	1884 nt		5.87	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	TAH18	YPR048W	1872 nt		5.86	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	PDI1	YCL043C	1569 nt		5.86	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	NOP16	YER002W	696 nt		5.86	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	CPA1	YOR303W	1236 nt		5.86	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	DOA1	YKL213C	2148 nt		5.86	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	NTH2	YBR001C	2343 nt		5.85	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	ASP1	YDR321W	1146 nt		5.85	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	CAB1	YDR531W	1104 nt		5.85	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	LYS5	YGL154C	819 nt		5.85	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	YOR024W	YOR024W	324 nt		5.85	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	HXT4	YHR092C	1731 nt		5.85	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	PDE1	YGL248W	1110 nt		5.84	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	YKL107W	YKL107W	930 nt		5.84	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	ADD37	YMR184W	597 nt		5.84	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	YPL199C	YPL199C	723 nt		5.84	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	MAL11	YGR289C	1851 nt		5.83	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	VAM7	YGL212W	951 nt		5.83	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	YGR291C	YGR291C	222 nt		5.83	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	SPC34	YKR037C	888 nt		5.83	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	APS1	YLR170C	471 nt		5.83	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	YMR030W-A	YMR030W-A	291 nt		5.83	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	YNL057W	YNL057W	333 nt		5.83	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	OCA1	YNL099C	717 nt		5.83	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	YBR298C-A	YBR298C-A	222 nt		5.83	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	RGT1	YKL038W	3513 nt		5.83	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	EPS1	YIL005W	2106 nt		5.83	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	FUI1	YBL042C	1920 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	PRR1	YKL116C	1557 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	ACC1	YNR016C	6702 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	NQM1	YGR043C	1002 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	CTR2	YHR175W	570 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	YNL217W	YNL217W	981 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	ARO7	YPR060C	771 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	CTS2	YDR371W	1536 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	APE1	YKL103C	1545 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	HRR25	YPL204W	1485 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	EIS1	YMR031C	2532 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	SIR2	YDL042C	1689 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	ERG7	YHR072W	2196 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	YDR053W	YDR053W	396 nt		5.81	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	YNL134C	YNL134C	1131 nt		5.81	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	MPP10	YJR002W	1782 nt		5.8	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	GSY2	YLR258W	2118 nt		5.8	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	VBA1	YMR088C	1689 nt		5.8	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	MMR1	YLR190W	1476 nt		5.8	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	HST4	YDR191W	1113 nt		5.8	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	MAP2	YBL091C	1266 nt		5.8	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	SLD2	YKL108W	1362 nt		5.8	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	FRE7	YOL152W	1863 nt		5.79	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	UGA2	YBR006W	1494 nt		5.79	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	SSZ1	YHR064C	1617 nt		5.79	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	RAM1	YDL090C	1296 nt		5.79	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	TBF1	YPL128C	1689 nt		5.79	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	DIT2	YDR402C	1470 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	YKL223W	YKL223W	333 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	TRM10	YOL093W	882 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	YEH2	YLR020C	1617 nt		5.77	□□□□□ -1.48
SYF1	Q04048	PRP31	YGR091W	1485 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	BUD7	YOR299W	2241 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	ENT5	YDR153C	1236 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	THI5	YFL058W	1023 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	YIR043C	YIR043C	693 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	RSA3	YLR221C	663 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	MID2	YLR332W	1131 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	SPS19	YNL202W	879 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	THI12	YNL332W	1023 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	LCB2	YDR062W	1686 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	OXP1	YKL215C	3861 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	LPL1	YOR059C	1353 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	HOF1	YMR032W	2010 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	ATR1	YML116W	1629 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	MMT2	YPL224C	1455 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	WTM1	YOR230W	1314 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	PRT1	YOR361C	2292 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	SKI6	YGR195W	741 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	YKR041W	YKR041W	753 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	OSW5	YMR148W	447 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	URE2	YNL229C	1065 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	TIP41	YPR040W	1071 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	SWI3	YJL176C	2478 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	SIF2	YBR103W	1608 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	RAT1	YOR048C	3021 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	PMT2	YAL023C	2280 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	YNK1	YKL067W	462 nt		5.75	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	DBR1	YKL149C	1218 nt		5.75	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	YLR296W	YLR296W	327 nt		5.75	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	MDG1	YNL173C	1101 nt		5.75	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	REI1	YBR267W	1182 nt		5.75	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	HPF1	YOL155C	2904 nt		5.75	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	NGR1	YBR212W	2019 nt		5.75	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	ERG4	YGL012W	1422 nt		5.74	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	ABZ1	YNR033W	2364 nt		5.74	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	RPS16B	YDL083C	432 nt		5.74	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	SFT2	YBL102W	648 nt		5.74	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	MRI1	YPR118W	1236 nt		5.74	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	ACP1	YKL192C	378 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	YNL174W	YNL174W	573 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	ISU2	YOR226C	471 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	GIP1	YBR045C	1920 nt		5.73	□□□□□ -1.49

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