Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPCQ03188 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms