Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP2Q03169 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms